我科學(xué)家率先繪就家蠶超級泛基因組圖譜-當前速遞

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本報重慶10月10日電（記者李宏、張國圣）西南大學(xué)近日發(fā)布最新研究成果：家蠶基因組生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室主任、國家蠶桑產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系首席科學(xué)家代方銀教授團隊完成家蠶大規模種質(zhì)資源基因組解析（“千蠶基因組”），在全球首次繪就家蠶超級泛基因組圖譜，并率先實(shí)現了家蠶這個(gè)物種遺傳信息的數字化——“數字家蠶”。

家蠶是重要的經(jīng)濟昆蟲(chóng)和新興模式生物，之前僅有單一參考基因組及部分重測序，不足以支撐基因組變異和優(yōu)良基因的深度挖掘，尤其對于分子育種具有顯著(zhù)局限。而超級泛基因組是一個(gè)物種所有基因組信息的總和，對于深化功能基因組研究、種質(zhì)創(chuàng )新等意義重大。

“家蠶超級泛基因組圖譜是涵蓋了蠶的所有遺傳信息的一張圖，通過(guò)這張圖我們可以直接對接表型和基因組密碼?！贝姐y打比方說(shuō)，以前鑒定特定性狀的基因或其因果變異猶如“大海撈針”，現在可謂是“甕中捉鱉”，因為超級泛基因組為此提供了“精細網(wǎng)格化”的“坐標”指導，對于行家里手來(lái)說(shuō)像是“查字典”。

據西南大學(xué)家蠶基因組生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室教授、博士生導師童曉玲介紹，研究團隊對1078份蠶種質(zhì)資源進(jìn)行了測序，其中包括47個(gè)野桑蠶、205個(gè)家蠶地方種、194個(gè)實(shí)用種和632個(gè)突變體，繪制出了一個(gè)高精度家蠶泛基因組圖譜。該超級泛基因組囊括了目前最全面的家蠶和野桑蠶基因組信息，是迄今全球動(dòng)植物領(lǐng)域最大的長(cháng)讀長(cháng)泛基因組。同時(shí)，團隊還對蠶的各種遺傳變異、群體結構、人工選擇和生態(tài)適應性及經(jīng)濟性狀開(kāi)展了深入的研究，取得了豐碩的創(chuàng )新結果。

家蠶起源于我國，由中國古野桑蠶馴化而來(lái)，具有5000多年的馴養歷史，但其馴化起源地是長(cháng)期懸而未決的問(wèn)題，特別是缺乏有力的生物學(xué)證據。本研究的材料呈現了來(lái)自全球各主要養蠶地區的最豐富的遺傳多樣性，研究發(fā)現黃河中下游地區的地方種分布在進(jìn)化樹(shù)上家蠶分支的基部，表明家蠶起源于黃河中下游地區。

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關(guān)鍵詞： 黃河中下游地區 遺傳信息 西南大學(xué)